Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RANGAP1P46060 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RANGAP1P46060 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms