Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSFMP43897 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSFMP43897 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSFMP43897 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSFMP43897 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSFMP43897 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSFMP43897 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSFMP43897 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSFMP43897 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSFMP43897 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSFMP43897 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSFMP43897 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSFMP43897 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSFMP43897 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms