Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGAEP38570 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGAEP38570 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms