Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJC1P36383 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJC1P36383 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms