Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms