Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTX2P32243 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTX2P32243 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms