Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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CASQ1P31415 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CASQ1P31415 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CASQ1P31415 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CASQ1P31415 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CASQ1P31415 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CASQ1P31415 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CASQ1P31415 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CASQ1P31415 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CASQ1P31415 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CASQ1P31415 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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CASQ1P31415 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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