Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPS1P31327 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPS1P31327 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPS1P31327 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPS1P31327 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPS1P31327 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPS1P31327 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CPS1P31327 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPS1P31327 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPS1P31327 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPS1P31327 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPS1P31327 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPS1P31327 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPS1P31327 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPS1P31327 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPS1P31327 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPS1P31327 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPS1P31327 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPS1P31327 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPS1P31327 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPS1P31327 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms