Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMPK1P30085 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms