Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCAP28676 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCAP28676 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCAP28676 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms