Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIFP27352 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIFP27352 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms