Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTX3P26022 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTX3P26022 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms