Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB7P26010 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB7P26010 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB7P26010 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB7P26010 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGB7P26010 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms