Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms