Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTSSP25774 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms