Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKCHP24723 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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