Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HRCP23327 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HRCP23327 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HRCP23327 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HRCP23327 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HRCP23327 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HRCP23327 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms