Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms