Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
USF1P22415 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
USF1P22415 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USF1P22415 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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