Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA5P20719 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms