Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VCLP18206 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VCLP18206 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VCLP18206 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VCLP18206 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VCLP18206 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VCLP18206 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VCLP18206 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VCLP18206 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VCLP18206 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VCLP18206 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VCLP18206 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VCLP18206 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VCLP18206 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VCLP18206 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VCLP18206 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VCLP18206 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VCLP18206 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VCLP18206 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VCLP18206 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VCLP18206 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VCLP18206 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VCLP18206 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VCLP18206 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VCLP18206 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VCLP18206 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VCLP18206 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VCLP18206 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VCLP18206 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms