Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSPP15924 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSPP15924 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSPP15924 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSPP15924 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSPP15924 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSPP15924 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSPP15924 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSPP15924 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSPP15924 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSPP15924 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSPP15924 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSPP15924 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSPP15924 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DSPP15924 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSPP15924 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSPP15924 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms