Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRG2P13727 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms