Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTN1P12814 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms