Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRP12270 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRP12270 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRP12270 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRP12270 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRP12270 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRP12270 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRP12270 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRP12270 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPRP12270 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPRP12270 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPRP12270 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRP12270 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRP12270 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRP12270 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRP12270 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRP12270 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRP12270 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRP12270 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRP12270 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRP12270 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRP12270 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRP12270 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRP12270 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPRP12270 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms