Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A1P11836 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms