Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DMDP11532 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DMDP11532 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DMDP11532 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DMDP11532 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DMDP11532 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DMDP11532 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DMDP11532 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DMDP11532 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DMDP11532 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DMDP11532 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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