Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD8BP10966 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD8BP10966 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD8BP10966 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms