Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI3P10071 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI3P10071 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI3P10071 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI3P10071 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI3P10071 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms