Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC166P0CW27 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms