Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBP07199 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBP07199 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms