Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLSTN1O94985 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms