Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLIT2O94813 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms