Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms