Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms