Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms