Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SYNGR3O43761 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYNGR3O43761 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYNGR3O43761 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYNGR3O43761 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SYNGR3O43761 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYNGR3O43761 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SYNGR3O43761 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SYNGR3O43761 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR3O43761 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms