Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PLXNB1O43157 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PLXNB1O43157 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms