Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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CEP290O15078 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP290O15078 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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CEP290O15078 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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CEP290O15078 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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CEP290O15078 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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CEP290O15078 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP290O15078 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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CEP290O15078 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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CEP290O15078 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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CEP290O15078 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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CEP290O15078 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP290O15078 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP290O15078 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP290O15078 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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