Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCF2LO15068 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms