Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms