Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms