Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A4D1N5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A4D1N5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A4D1N5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms