Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAP3K4Q9Y6R4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms