Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C2

EMILIN1, EMILIN-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN1Q9Y6C2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMILIN1Q9Y6C2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms