Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms