Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms