Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms