Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLKQ9UBT6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms