Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK3Q9UBP4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms